女朋友卷我钱跑了，我要起诉他，他说我起诉他他就告我强奸?

针对你“女朋友卷我钱跑了，我要起诉她，她却说我起诉她她就告我强奸”的情况，起诉她追回钱款是你的合法权利，她以强奸相威胁的行为是违法的。
如果或若存在你与女朋友之间有明确的借贷合意，比如有借条、聊天记录明确约定了借款金额、还款时间等，那么你可以以民间借贷纠纷为由起诉她，要求她返还借款。在此情况下，你需要提供借条、转账记录、体现借贷合意的聊天记录等证据。

如果或若存在你女朋友是以非法占有为目的，通过虚构事实、隐瞒真相的方法骗取了你的钱财，比如她虚构投资项目、家人生病等理由向你索要钱财后消失，那么她的行为可能构成诈骗罪，你可以向公安机关报案，由公安机关立案侦查。此时，你需要提供转账记录、她虚构事实的相关证据（如聊天记录、录音等）、她消失的相关证明等。
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你提到“女朋友卷我钱跑了，我要起诉她”，起诉她追回钱款的法律依据主要涉及《中华人民共和国民事诉讼法》和《中华人民共和国民法典》中关于民间借贷以及侵权责任的相关规定。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十二条规定，起诉必须符合下列条件：（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；（二）有明确的被告；（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。在你起诉女朋友追回钱款的情况中，你作为钱款的出借人或所有人，是与本案有直接利害关系的公民，你的女朋友是明确的被告，你有要求她返还钱款的具体诉讼请求以及她卷钱跑了的事实和理由，该纠纷属于人民法院受理民事诉讼的范围，所以你符合起诉条件，可以依法提起诉讼。

《中华人民共和国民法典》第六百七十五条规定，借款人应当按照约定的期限返还借款。对借款期限没有约定或者约定不明确，依据本法第五百一十条的规定仍不能确定的，借款人可以随时返还；贷款人可以催告借款人在合理期限内返还。如果你与女朋友之间存在借贷关系且约定了还款期限，她未按约定返还，你有权起诉要求她返还；若未约定还款期限，你催告后她仍不返还，你也可起诉。
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面对“女朋友卷我钱跑了，我要起诉她，她却说我起诉她她就告我强奸”的状况，以下是几点实用的行动建议，希望能帮助你应对。
1、收集并固定证据：收集所有与钱款往来相关的证据，如转账记录（银行转账凭证、微信或支付宝转账截图等）、聊天记录（体现借贷合意、她承认收到钱款等内容）、借条（如有）等，同时也要保存好她威胁要告你强奸的相关证据，如短信、微信聊天记录、通话录音等。这些证据是你维护自身权益的关键，能证明钱款的性质以及她威胁你的事实。

2、明确诉讼请求和法律关系：仔细梳理你与女朋友之间的关系以及钱款的性质，确定是以民间借贷纠纷还是其他法律关系起诉。如果是借贷，明确借款金额、利息（如有约定且符合法律规定）等诉讼请求；如果涉及诈骗，及时整理证据向公安机关报案。清晰的法律关系和明确的诉讼请求有助于提高诉讼效率。

3、咨询专业律师：携带收集到的证据咨询专业律师，律师会根据你的具体情况分析案件的胜诉可能性、诉讼风险以及应对她威胁的策略。律师还能指导你撰写起诉状、准备证据材料等，确保诉讼程序的顺利进行。

4、选择合适的管辖法院起诉：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，一般由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。如果是合同纠纷，也可以由合同履行地人民法院管辖。选择有管辖权的法院起诉，能避免因管辖问题耽误诉讼时间。

选择解决方案时，应重点考虑证据的充分性、法律关系的清晰度以及自身的实际需求和成本。如果你希望尽快解决问题且证据充分，诉讼可能是较好的选择；如果涉及刑事犯罪，报案则更为合适。如果你在采取行动过程中遇到任何疑问，建议进一步向律师详细咨询，以获得更精准的法律帮助。